公司为员工缴纳社保时，涉及到的费用是由企业和员工共同承担的。具体到个人部分的扣除，通常遵循以下流程和原则：

根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位在发放工资时，会按照国家规定的社保缴纳比例和员工的工资基数，计算出员工个人需要承担的社保费用，并从工资中扣除，然后连同单位自身需要承担的社保费用部分一并缴纳给社保机构 。

社会保险个人缴纳部分的计算公式是：月工资×个人应承担的缴费比例。例如，在养老保险方面，个人需承担8%的比例；医疗保险通常是2%；失业保险一般是0.5%左右，而工伤保险和生育保险则完全由企业承担，个人无需缴纳 。

实际操作中，公司在每个月发放工资前会先计算每个员工的社保费用。这包括了个人和公司的部分。对于个人而言，其承担的部分将直接从当月的工资中扣除。这个过程通常是在工资结算之前完成的，以确保按时向社保机构支付费用 。

不同地区的社保政策可能会有所不同，因此具体的缴费比例也会有所差异。例如，在某些地区，养老保险的个人缴费比例可能设定为8%，而在其他地区则可能是不同的数值 。同样地，医疗保险、失业保险等的具体比例也会根据当地的法规进行调整。

值得注意的是，社保缴费基数并不是随意确定的，而是基于职工的实际工资水平以及当地上一年度职工平均工资来决定的。如果职工的工资收入高于当地上年度职工平均工资的300%，那么其社保缴费基数就以这个上限来确定；反之，若低于当地上一年职工平均工资的60%，则以其下限来确定 。

最后，为了确保社保扣款过程透明公正，员工有权了解自己的社保缴纳情况。可以通过查看工资条上的明细，或者通过一些官方的应用程序如新社通app查询个人的社保缴纳记录 。如果发现有任何疑问或问题，应及时与公司的人力资源部门沟通，必要时还可以向当地的社保部门咨询或投诉 。这样可以确保每一位员工都能清楚了解自己社保费用的扣除情况，并且保证权益不受侵害。

公司为员工缴纳社保时，个人部分的扣除是一个严格按照法律法规执行的过程，旨在保障劳动者的合法权益和社会福利。同时，这也要求企业和个人都要遵守相关规定，及时足额地缴纳社保费用。