江西新余社保基数21800元和5000元的区别主要体现在缴费金额、个人账户金额、养老保险待遇以及适用的险种等方面，具体如下：
缴费金额
- 养老保险：
- 基数为21800元时，个人缴费部分为21800元 × 8% = 1744元，企业缴费部分为21800元 × 16% = 3488元。
- 基数为5000元时，个人缴费部分为5000元 × 8% = 400元，企业缴费部分为5000元 × 16% = 800元。
- 医疗保险：
- 基数为21800元时，单位和个人缴费总和为（21800 × 8% + 21800 × 2%）× 12 = 2491.2元。
- 基数为5000元时，单位和个人缴费总和为（5000 × 8% + 5000 × 2%）× 12 = 768元。
- 失业保险：
- 基数为21800元时，单位和个人缴费总和为（21800 × 2% + 21800 × 1%）× 12 = 739.2元。
- 基数为5000元时，单位和个人缴费总和为（5000 × 2% + 5000 × 1%）× 12 = 168元。
个人账户金额
- 基数为21800元时，个人账户金额为1744元。
- 基数为5000元时，个人账户金额为400元。
养老保险待遇
- 缴费基数越高，个人账户积累越多，退休后领取的养老金也相应越多。
- 缴费基数为21800元时，由于缴费基数高，个人账户积累较多，因此退休后领取的养老金也会相对较高。
适用的险种
- 养老保险：个人缴费部分完全计入个人账户，企业缴费部分全部划入社会统筹基金。
- 医疗保险：单位和个人共同承担，个人缴费部分计入个人账户，企业缴费部分划入社会统筹基金。
- 失业保险：单位和个人共同承担，个人缴费部分计入个人账户，企业缴费部分划入社会统筹基金。
总的来说，选择较高的社保缴费基数虽然会导致当前的缴费金额增加，但长远来看，有利于个人在退休时获得更高的养老金待遇，并享受更全面的社保保障。