内蒙古自治区医保系统在星期天是否可以报销，取决于具体的报销类型和服务机构。以下是详细说明：
1. 门诊报销
- 定点医疗机构：在内蒙古的定点医疗机构，门诊报销服务通常不受星期天限制，参保人员可以正常使用医保进行结算。
- 注意事项：具体报销比例和额度会根据医院级别有所不同，例如三级医院报销比例为60%，二级医院为80%。
2. 住院报销
- 定点医院：住院报销同样不受星期天限制，参保人员可以在定点医院正常享受医保待遇。
- 特殊情况：住院期间，门诊统筹待遇不可使用，需特别注意。
3. 异地就医
- 备案要求：异地就医需要提前备案，备案后星期天也可正常报销。
- 注意事项：未备案的异地就医可能无法享受医保报销。
4. 药店购药
- 定点药店：参保人员在定点药店购药，星期天也可正常使用医保进行结算。
- 报销比例：药店购药报销比例为60%，年度最高支付限额为500元。
5. 特殊提醒
- 节假日政策：医保报销政策可能会因节假日调整，建议提前咨询当地医保部门或拨打服务热线确认。
- 政策更新：内蒙古医保政策可能会更新，建议定期关注医保官网或相关公告。
内蒙古医保系统在星期天大部分情况下可以正常报销，但具体服务可能因医院、药店或政策而有所不同。建议参保人员根据自身需求，提前了解相关政策和具体规定，确保医保权益得到保障。