电子医保卡已经激活了还是不能用的原因如下：

1. 医保个人账户的钱还未划账：医保卡个人账户中如果没有足够的余额，那么即使激活了也无法使用。这是因为医保卡中的钱通常是由医保局定期划拨的，如果参保人的个人资金还没有划入账户，那么医保卡就不能用来支付医疗费用和药品费用。

2. 医保卡芯片损坏：如果医保卡的芯片损坏，那么即使激活了也无法正常使用。在这种情况下，需要到医院的医保办或者社保局进行补办。

3. 医院不是医保指定医院：电子医保卡的使用可能受到医院是否为医保指定医院的限制。如果用户就诊的医院不在医保指定范围内，那么即使电子医保卡已经激活，也可能无法使用。

4. 就诊项目不在医保报销范围：如果用户就诊的项目或药品不在当地的医保报销范围内，那么即使电子医保卡已经激活，也无法使用它来支付相关费用。

5. 医保电子凭证激活后未在医院使用：医保电子凭证激活后，需要在医院进行相关设置才能使用。例如，在长沙，职工医保参保人在定点医院门诊看病从10月起可以报销，结算时，如果没带身份证或社会保障卡，凭手机里的医保电子凭证也可以进行身份识别。

电子医保卡或医保电子凭证在激活后可能出现的问题有很多，需要根据具体情况进一步排查。