单位医保断缴三个月后的补缴流程及注意事项如下：

一、补缴时间要求

1. 中断3个月内补缴

   若单位在职工医保断缴后3个月内完成补缴，缴费次月起即可恢复医保待遇，且中断期间的医疗费用可追溯享受。

2. 超过3个月补缴

   • 灵活就业人员 ：部分地区允许补缴，但需按补缴时当地上年度职工平均工资为缴费基数补缴全部欠费，补缴后次月开始享受待遇。

   • 职工身份 ：超过3个月通常需重新参保，补缴后设6个月等待期才能恢复待遇。

二、补缴所需材料

1. 必备材料

   • 身份证

   • 医疗保险证/卡

   • 银行卡（用于缴费）。

2. 特殊情况补充材料

   • 离职人员需提供离职证明

   • 单位欠费需提供《社会保险费补缴通知单》。

三、补缴方式

1. 线上办理

   登录当地社保局官网或APP，通过“医保补缴”入口办理。

2. 线下办理

   携带材料至当地社保局窗口办理，支持银行转账、微信/支付宝支付。

四、注意事项

1. 滞纳金与罚款

   • 欠费需缴纳0.5%-3%的滞纳金，逾期不缴可能面临罚款。

   • 单位欠费除补缴外，还需承担滞纳金和罚款。

2. 个人账户处理

   • 补缴后个人账户可正常使用，但断缴期间个人缴费部分不计入连续缴费年限。

3. 地区政策差异

   • 部分地区对灵活就业人员补缴有特殊规定，建议提前咨询当地社保局。

五、特殊情况处理

• 单位破产/兼并 ：欠费单位需与清算组或新单位签订补缴协议。

• 职工个人补缴 ：离职人员可自行向社保局申请补缴，但需符合当地规定。

通过以上步骤，单位可在规定时间内完成医保补缴并恢复待遇。若超过3个月未补缴，建议重新参保并了解当地最新政策。