传统上癫痫可以大致分为原发性癫痫和继发性癫痫。继发性癫痫主要是继发于其他疾病的癫痫，往往存在阳性影像学表现或者明确的病史。例如肿瘤、外伤、卒中感染、脑积水等其他疾病合并的癫痫。原发性癫痫病因比较隐匿，缺乏明显的阳性体征，或者说是影像学表现。但是随着现代医学的发展和进步，部分所谓的原发性癫痫也逐渐找到了病因。例如海马硬化、局灶性皮层发育不良FCD、未知异位、线性硬化等等。通过针对性的治疗也可以取得比较好的疗效。
癫痫是最为严重且常见的神经系统慢性疾患之一，以反复的癫痫发作为特征，但是至今病因不明。在国际抗癫痫联盟2017年发布的最新版的癫痫分类中，已经将癫痫的病因归纳为结构性、遗传性、感染性、代谢性、免疫性以及未知六大类。
