疾病预防控制机构的归属管理部门需根据具体层级和职能进行区分，主要分为以下情况：

一、国家层面

中国疾病预防控制中心（中国疾控中心）由 国家卫生健康委 划转至国家疾控局管理，属于 国家疾控局直属事业单位 。其职责涵盖全国疾病预防控制、公共卫生事件应急响应、科研支撑及政策建议等。

二、地方层面

1. 县级及以上疾控中心

   通常归 同级卫生健康委 管理，属于其直属事业单位。例如常州市新北区疾病预防控制中心，负责本行政区域内的疾病预防控制、监测与应急响应等工作。

2. 市县级疾病预防控制站（原卫生防疫站）

   曾属于 县级卫生局 管理，但自2024年6月起整合至疾病预防控制中心体系，现由同级疾控中心负责具体业务。

三、其他相关说明

• 疾病预防控制局 本身是 国家公共卫生计生委下属的参公单位 （如北京疾病预防控制局），并非疾病预防控制机构的直接管理部门。

• 疫情防控专项机构 （如新冠疫情防控指挥部）属于临时性机构，通常在特定时期成立，负责专项防控任务，与常规疾病预防控制机构职能不同。

总结

疾病预防控制机构的管理部门需结合“分级负责、专业管理”的原则，国家层面归国家疾控局，地方层面归同级卫生健康委，而原卫生防疫站职能已并入疾控中心体系。