食品经营许可证过期后继续经营被查处的处理方式主要依据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定。具体处理措施如下：
一、违法行为的认定
根据《中华人民共和国食品安全法》第一百二十二条，食品经营许可证过期后继续经营的行为，将被视为未取得食品生产经营许可从事食品生产经营活动，即构成违法行为。
二、处罚措施
- 没收违法所得和违法物品：县级以上人民政府食品安全监督管理部门将没收违法所得和违法生产经营的食品、食品添加剂以及用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品。
- 罚款：根据违法生产经营的食品、食品添加剂货值金额的不同，罚款的数额也有所区别。具体而言：
- 货值金额不足一万元的，并处五万元以上十万元以下罚款。
- 货值金额一万元以上的，并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款。
三、其他可能的处罚
除了上述的没收违法所得和罚款，还可能包括责令停业整顿、吊销营业执照等更严厉的处罚措施。对于情节严重者，还可能涉及刑事责任。
四、应对方法
- 提前办理续期：密切关注许可证的有效期限，提前了解并准备续期所需材料，确保在许可证到期前完成续期申请，避免出现“空窗期”。
- 立即停止经营：一旦发现许可证已过期，应立即停止所有食品经营活动，尽快办理续期或重新申请许可证。在未取得有效许可证之前，不得恢复经营，以规避法律风险。
- 主动整改：如因经营条件不达标导致无法顺利续期，应按照监管部门要求进行整改，提升食品安全管理水平，直至达到许可标准。
- 公开透明沟通：对于因特殊情况导致暂时无法正常经营的，应及时向消费者、供应商等利益相关方进行公开、透明的沟通，解释原因，争取理解与支持，尽可能降低信誉损失。
食品经营许可证过期无疑被视为无证经营，这对商家来说不仅意味着法律责任、经济风险和信誉损害，更关乎消费者的生命健康安全。因此，食品经营者必须高度重视许可证的有效管理，确保始终在合法合规的前提下开展经营活动。