根据最新政策，连云港医保在南京的使用情况如下：

一、门诊购药

1. 支持异地联网直接结算

   连云港已开通职工医保异地就医零售药店直接结算，与南京等城市实现双向联网。参保人员办理异地就医备案后，可在南京已开通的异地联网定点零售药店直接刷卡购药，费用由医保个人账户支付，不足部分自费。

2. 备案办理要求

   需在连云港办理异地就医备案手续，可通过线上渠道申请并生成《异地就医登记备案表》。

二、住院医疗

• 直接结算支持 ：连云港与南京的定点医疗机构已实现联网，参保人员可直接刷卡结算住院费用。

• 转诊流程 ：若需转诊至南京治疗，需提供转诊证明，回参保地（连云港）报销。

三、其他注意事项

1. 社保卡使用限制

   • 门诊回连云港 ：可使用连云港医保卡直接结算门诊费用。

   • 跨市就医 ：需办理异地就医备案并申领江苏省社会保障卡（部分地区需先在南京参保）。

2. 特殊情况处理

   • 中断社保影响 ：若南京中断社保，连云港医保将无法使用；反之亦然。

   • 北京就医 ：需在连云港参保并转移北京个人账户，或回北京就医全额自费。

四、建议操作步骤

1. 线上备案 ：通过连云港社保官网或APP办理异地就医备案。

2. 材料准备 ：就医时携带身份证、医保卡及备案表，确保药店支持异地结算。

以上信息综合了医保政策及最新改革措施，确保参保人员在不同城市就医时能够顺利享受医保待遇。