呼伦贝尔市下属的旗县众多，以下是具体的列表：
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海拉尔区：隶属于内蒙古自治区呼伦贝尔市，是呼伦贝尔市人民政府所在地，是呼伦贝尔市政治、经济、文化、医疗、教育、交通、信息、旅游中心。
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扎赉诺尔区：隶属于内蒙古自治区呼伦贝尔市，由满洲里市代管。总面积312平方公里。
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阿荣旗：隶属内蒙古自治区呼伦贝尔市的一个旗，位于大兴安岭东麓，面积13641平方公里。
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莫力达瓦达斡尔族自治旗：简称莫旗，成立于1958年8月15日，是全区三个少数民族自治旗之一，全国唯一的达斡尔族自治旗，全旗有17个民族，主体民族是达斡尔族。
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鄂伦春自治旗：是中国三个少数民族自治旗之一，鄂温克族实行民族区域自治的地方，是全国唯一的鄂伦春族自治旗。
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鄂温克族自治旗：是中国三个少数民族自治旗之一，是鄂温克民族实行民族区域自治的地方。
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陈巴尔虎旗：隶属内蒙古自治区呼伦贝尔市，位于中国内蒙古自治区呼伦贝尔市西北部，地处呼伦贝尔大草原腹地，地理坐标为北纬48°48′—50°12′、东经118°22′—121°02′之间。
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新巴尔虎左旗：隶属内蒙古自治区呼伦贝尔市，位于呼伦贝尔市西南端，土地面积2.2万平方公里。
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新巴尔虎右旗：是自治区 19 个边境旗（市）和 23 个牧业旗之一，位于祖国东北边陲，呼伦贝尔市西部中俄蒙三国交界处。
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满洲里市：由内蒙古自治区呼伦贝尔市代管，是内蒙古自治区计划单列市，是中国最大的陆运口岸城市，总面积453平方公里。
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牙克石市：内蒙古自治区呼伦贝尔市下辖县级市，位于呼伦贝尔市中部，总面积27590平方公里。
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扎兰屯市：是呼伦贝尔市下辖县级市，是内蒙古岭东地区政治、经济、文化、医疗、交通中心，呼伦贝尔副中心城市，中国优秀旅游城市，呼伦贝尔市商品交易中心之一。
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额尔古纳市：是内蒙古自治区呼伦贝尔市下辖县级市，位于内蒙古自治区呼伦贝尔市大兴安岭西北麓，呼伦贝尔草原北端，额尔古纳河右岸。
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根河市：是内蒙古自治区呼伦贝尔市下辖县级市，“根河”是蒙古语“葛根高勒”的谐音，意为“清澈透明的河”。
总的来说，呼伦贝尔市下属的旗县包括多个市辖区、县级市以及旗和自治旗，这些行政区划共同构成了呼伦贝尔市的行政区划体系。
