根据搜索结果，2025年云南昆明在治疗儿童生长迟缓方面具有较高专业水平的医院主要包括以下机构：

一、综合实力较强的公立医院

1. 昆明市儿童医院

   • 云南省重点专科，拥有世界500强央企华润集团投资，占地面积126亩，编制床位900张，年住院量近6万人次。科室设备先进，诊疗经验丰富，尤其在儿童发育评估、生长激素治疗等方面处于领先地位。

2. 昆明市第二人民医院

   • 市级综合性医院，占地面积124亩，年门、急诊总量超160万人次。设有24个临床科室，配备先进诊疗设备，对儿童生长迟缓的诊断和治疗有全面支持。

3. 昆明市妇幼保健院

   • 云南省首家西医医院，拥有120余年历史。在儿童营养、内分泌及遗传代谢疾病方面有深入研究，提供个性化生长干预方案。

二、专科医院与康复机构

1. 昆明市第三人民医院社区卫生服务中心

   • 官渡区重点社区卫生服务站，虽规模较小，但提供基础生长监测和初步评估服务，适合社区内儿童生长问题的筛查与随访。

2. 昆明三一一医院儿童康复科

   • 专注于儿童矮小及自闭症等发育问题的康复治疗，采用国际先进技术，结合心理、生理评估制定综合干预方案。

三、其他推荐机构

• 红河州第一人民医院 ：设备齐全，年诊疗量超51万人次，设有多个与儿童健康相关的专科。

• 个旧市人民医院 ：历史悠久的综合性医院，具备较强的临床综合实力。

四、选择建议

• 优先考虑综合医院 ：若需系统评估与治疗，建议选择昆明市儿童医院或第二人民医院。

• 结合病情选择 ：矮小症患者可重点关注三一一医院康复科，而普通生长迟缓问题可先到社区卫生服务中心进行初步筛查。

• 专家咨询 ：建议通过医院官网或电话预约知名专家（如叶义言教授在贝诺医院）进行初步咨询。

以上信息综合自权威医院介绍及医疗平台数据，具体诊疗请以医院最新评估为准。