上海儿科医院和儿童医院各有其特色和优势，具体选择哪家医院更好，建议家长根据以下因素进行综合考虑：
- 医院的专业特长 ：
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复旦大学附属儿科医院 ：全国最好的儿科专科医院之一，集医、教、研、防、管为一体，拥有强大的儿科医学实力，尤其在小儿内科和小儿外科领域有很高的声誉。
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上海儿童医学中心 ：由上海市人民政府与世界健康基金会合作共建，集医、教、研于一体，拥有多个在国内外具有重要影响力的优势特色学科，如小儿心血管、儿童血液肿瘤、儿童保健（发育行为儿科）。
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上海交通大学医学院附属新华医院 ：以小儿外科见长，尤其是小儿先天性心脏病、小儿肿瘤等领域有很高的声誉。
- 地理位置和交通便利性 ：
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复旦大学附属儿科医院 ：位于上海市闵行区万源路399号，交通便利，方便家长和患儿就诊。
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上海儿童医学中心 ：位于上海市浦东新区东方路1678号，同样交通便利。
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上海交通大学医学院附属新华医院 ：位于上海市杨浦区控江路1665号，靠近市中心，方便就诊。
- 医院的环境和服务 ：
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复旦大学附属儿科医院 ：有地方停车，环境较好，护士和医生态度非常好，医生专业且耐心。
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上海儿童医学中心 ：医院占地面积大，环境优美，设施先进，提供全面医疗服务。
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上海交通大学医学院附属新华医院 ：拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备，服务态度好。
- 医院的收费情况 ：
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复旦大学附属儿科医院 ：作为三级甲等医院，收费标准相对较高，但提供高质量的医疗服务。
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上海儿童医学中心 ：收费标准也较高，但其在儿科领域的专业性和设施优势使其物有所值。
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上海交通大学医学院附属新华医院 ：作为综合性医院，儿科收费相对较为合理。
建议
家长可以根据孩子的具体病情和需求，结合医院的专科特长、地理位置、交通便利性、环境和服务以及收费情况，选择最适合的医院进行就诊。如果孩子在小儿内科或小儿外科方面有特殊需求，复旦大学附属儿科医院和上海儿童医学中心是不错的选择；如果孩子在小儿外科方面需要高水准的医疗服务，新华医院也是一个很好的选择。建议家长提前预约挂号，以确保能够顺利就诊。