​​在漳州办理特殊病种可前往线下医保经办机构、二级及以上定点医院医保服务站，还能线上通过闽政通APP、福建省网上办事大厅操作，部分业务即时办结，高效便捷。​​

漳州特殊病种线下办理地点，参保人员可在被诊断出相关疾病后，前往具有认定资质的二级（含）以上综合性或专科定点医院就诊，由医生开具《门诊慢特病病种待遇认定申请表》，然后携带该表和相关病历资料，前往医保服务站或参保地医保经办机构办理备案登记。若是跨省异地就医直接结算相关业务，可在福建省内任一医保经办窗口或二级及以上公立医疗机构医保服务站办理。

线上办理途径丰富。可通过闽政通APP，点击“医保服务”，接着点击“门诊慢特病病种申请”，填写信息后提交申请，还能在“我的办件”中随时查看办理进度；也能登录福建省网上办事大厅，选择“基本医疗保险参保人员享受门诊慢特病病种待遇认定”并按照提示操作。

2025年起漳州医保新规实施后，办理流程进一步优化。参保患者自行选择市内已纳入门诊特殊病种管理的定点医疗机构或市外已开通门诊慢特病全国联网的定点医疗机构就诊即可，不受就诊定点医疗机构数量限制；起付标准根据就诊时定点医疗机构级别计算，年度内在更高级别医疗机构就诊，起付标准按就诊医疗机构级别补足；城乡居民医保支付比例也有所调整，如市内一级（含未定级）定点医疗机构提高至80%等 ，参保人员在享受待遇时，要按规定选择定点医疗机构就诊并遵循医保政策规定使用药品和诊疗项目。