新农合重大疾病二次报销的办理流程和注意事项如下：

一、报销条件

1. 基本要求

   需参加新农合且医疗费用超过起付线，且首次报销后自费部分仍符合大病报销标准。

2. 特殊病种

   部分城市将儿童白血病、宫颈癌等20余种重大疾病纳入二次报销范围，需提供特殊病种门诊治疗建议书等额外材料。

二、报销材料

1. 必备文件

   • 身份证或户口簿原件及复印件

   • 新农合医疗证或参合证原件

   • 第一次报销凭证（如补偿结算单）

   • 住院小结或出院小结原件及复印件

   • 医疗机构费用发票或加盖公章的复印件

   • 费用明细清单。

2. 特殊病种补充材料

   • 特殊病种门诊治疗建议书

   • 病历、化验报告单、照片等。

三、报销流程

1. 提出申请

   患者需在治疗后6个月内向参保地社保局或指定医疗机构提交申请，填写报销申请表。

2. 审核材料

   社保中心对提交的材料进行审核，包括医疗费用真实性、参合资格等。

3. 费用结算

   审核通过后，社保中心按比例计算报销金额，并将补偿资金拨付至患者指定银行账户。

四、注意事项

1. 时间限制

   报销需在治疗后6个月内提出，错过时效将无法受理。

2. 地区差异

   具体报销比例和起付线标准因地区而异，建议提前咨询当地社保部门。

3. 慢性病管理

   若患慢性病，需定期提交病历、检查报告等材料，且每人最多可申报3种慢性病。

五、办理渠道

• 线上办理 ：部分地区支持通过社保官网或手机APP提交材料。

• 线下办理 ：需前往参保地社保局或指定医疗机构报销窗口办理。

建议办理前电话咨询当地医保部门，确认具体材料清单和流程，避免遗漏。