新农合确实可以办理特殊病种，但具体政策因地区而异，需根据当地医保部门的规定执行。以下是综合整理的关键信息：

一、特殊病种认定范围

1. 常见病种

   包括慢性肾功能衰竭透析、恶性肿瘤门诊放化疗、器官移植术后抗排异治疗、重症尿毒症透析、高血压、糖尿病、恶性肿瘤等。

2. 重大疾病

   部分地区将乳腺癌、宫颈癌、终末期肾病等重大疾病纳入门诊特殊病种补偿范围。

二、申请条件

1. 疾病要求

   需符合当地医保部门公布的特殊病种目录，如糖尿病、高血压等。

2. 费用限制

   门诊医疗费用需达到当地规定的起付标准，且通常仅限门诊特定治疗项目。

三、申请流程

1. 提交材料

   包括身份证、合作医疗证、病历资料、诊断证明、检查报告等。

2. 审核登记

   通过当地新农合管理服务中心审核后，领取特殊病种证，作为就医报销凭证。

3. 就医结算

   在指定定点医疗机构就诊时，直接结算报销费用，部分地区支持即时结报。

四、报销比例与限额

• 报销比例 ：通常为门诊费用的50%-70%，具体比例因地区而异。

• 年度限额 ：部分地区设3万元年度最高补偿限额，住院费用不再享受门诊补偿。

五、注意事项

1. 地区差异 ：特殊病种目录及报销标准由各地医保部门制定，建议提前咨询当地医保局。

2. 动态调整 ：部分病种可能随政策调整，需关注最新医保文件。

若需办理，建议携带相关材料至户籍所在地新农合管理服务中心咨询具体流程及当地病种目录。