药物流产第三天孕囊未排出需根据具体情况采取以下处理措施，并建议及时就医评估：
一、观察与辅助措施
- 适当活动
通过散步、爬楼梯等轻量运动促进子宫收缩，加速孕囊排出。但需避免过度劳累或剧烈运动，以防引发大出血。 - 补充药物反应时间
部分患者服用米索前列醇后可能需要更长时间（如6小时以上）才能排出孕囊，需耐心观察。
二、药物干预
- 加服促进宫缩药物
在医生指导下加服米索前列醇（口服或阴道给药）或米非司酮，增强子宫收缩力。 - 辅助中成药
可配合益母草颗粒、新生化颗粒等药物，帮助排出残留组织。
三、医疗干预
- 紧急清宫术
若孕囊持续未排出且伴随腹痛、大出血或感染风险，需立即行清宫术清除残留物，避免并发症。 - 人工流产
特殊情况下（如孕囊位于宫角或瘢痕处），药物流产失败时需转为人工流产。
四、注意事项
- 及时就医：药流后超过24小时未排出孕囊或出现异常症状（如发热、持续腹痛、出血量＞月经量），需尽快完善B超等检查。
- 术后护理：无论是否排出孕囊，均需注意休息、保持外阴清洁，并遵医嘱复查。
提示：药物流产存在个体差异，上述措施需严格在医生指导下进行，不可自行调整用药。