住院自付比例的计算方法如下：

首先明确相关概念：

• 医疗总费用：参保人在住院期间产生的所有医疗费用，包括药品费、诊疗费、床位费等。
• 医保目录内费用：在医保三大目录（药品目录、医用耗材目录和医疗服务项目目录）范围内的费用，这部分费用可按规定由医保基金与患者个人按比例分担。
• 医保目录外费用：不在医保三大目录范围内的费用，需参保人全额自费，不纳入医保报销范围，也不计入自付比例的计算基数。
• 起付线：参保人在享受医疗费用报销之前需要自己先行支付的费用额度。只有超过起付线的费用才能按规定比例报销。
• 报销比例：根据参保人的医保类型（如职工医保、居民医保）以及就医医院的级别等因素确定的，医保基金对符合报销范围的费用进行报销的比例。

然后计算住院自付比例，公式为：住院自付比例个人自付费用医保目录内费用

其中，个人自付费用的计算方式为：个人自付费用医保目录内费用医保报销费用

医保报销费用的计算公式为：医保报销费用医保目录内费用起付线报销比例

例如，某参保人在三级医院住院，总花费万元，其中医保目录内费用万元，目录外自费费用万元，起付线元，医保报销比例为80%。则医保报销费用为(−)×80%=元，个人自付费用为−=元。那么住院自付比例为​×100%=21%。