药店不让刷医保卡是否合理，需结合具体情况判断，主要依据如下：
一、合法情形
非医保定点药店
若药店未通过医保部门审核成为定点单位，则无资格使用医保卡结算，拒绝刷卡属于正常行为。
药品不在医保目录
医保仅报销目录内药品，若所购药品（如保健品、医疗器械）不在目录内，拒绝刷卡是合规的。
账户异常或类型不符
医保账户余额不足、类型错误（如职工医保与居民医保混用）或卡片消磁等情况，均可能导致刷卡失败，需先解决账户问题。
二、违法情形
医保定点药店违规操作
若药店为医保定点单位，无正当理由拒绝刷卡（如故意规避医保报销），可能违反《社会保险法》相关规定，需承担法律责任。
串换药品或伪造凭证
药店负责人若诱导或强制患者使用电子凭证或串换药品进行刷卡，属于违法行为，可向医保局或食药监部门投诉。
三、处理建议
核实药店资质 ：通过官方渠道确认是否为医保定点单位。
检查药品目录 ：购药前确认药品是否在医保报销范围内。
处理异常情况 ：若账户或药品问题导致失败，及时联系医保经办机构解决。
投诉维权 ：遇违规行为可拨打12333医保热线或12315食药监热线投诉。
合理性与否需结合药店资质、药品类型及操作规范综合判断，建议优先通过官方渠道核实信息。