医保卡药店买药通常是扣的个人账户的钱，但也存在特殊情况会扣统筹账户的钱。

医保卡药店买药通常扣除的是医保个人账户余额。该账户用于记录医疗消费情况，存储个人缴纳的医疗保险费和单位缴费中按比例划入的资金。个人账户资金可用于支付门诊、急诊医疗费用及定点药店购药费用。但需注意，仅在指定药店购买医保目录内药品时可使用个人账户支付，并非所有药品均可报销。以下是医保卡药店买药扣款的相关信息：

扣款账户 用途 资金来源 个人账户 门诊、急诊医疗费用；定点零售药店购药费用；基本医疗保险统筹基金起付标准以下的医疗费用；超过基本医疗保险统筹基金起付标准，按照比例应当由个人负担的医疗费用 职工个人缴纳的基本医疗保险费；用人单位为职工缴纳的基本医疗保险费按比例划入的部分；个人账户中的利息收入 统筹账户 住院治疗的医疗费用；急诊抢救留观并收入住院治疗的，其住院前留观7日内的医疗费用；恶性肿瘤放射治疗和化学治疗、肾透析、肾移植后服抗排异药的门诊医疗费用 所有参保人共同缴纳医保费用

在某些情况下，如个人账户余额不足，需要使用统筹账户补足；或者医保规定某些药品只能使用个人账户支付，所以会同时扣除两个账户的款项。医保系统出现异常也可能导致重复扣款。