有线上和线下两种方式查询农保缴费证明。

线上查询

1. 支付宝查询：打开手机上的支付宝APP，打开后点击界面右上角的卡包按钮；进入卡包页面后，将页面下划到最底部，找到并点击证件旁边的查看全部文字；进入证件页面后，找到电子社保卡，点击下方的查看电子证件按钮（初次使用需要添加并且进行身份验证）；进入电子社保卡页面后，点击社保卡下方的社保查询按钮；进入社保查询页面后即可进行多个项目的查询。
2. 微信查询：打开微信，找到添加朋友的按钮，输入社保通五险查询，然后点击搜索；找到社保通五险查询之后，关注该公众号，接下来进行个人信息认证；输入数字0，显示帮助菜单选项，会详细列出各个数字键的作用，包含的个人五险或其他保险的缴费情况及消费明细记录；然后输入数字1，即可查询新农保的缴费情况，还可以查询近三个月的农保缴费情况；输入其他数字还可以查询用户五险一金等保险的缴费情况。
3. 官网查询：用户可登录参保地社会保险公共服务平台，点击个人用户进行登录，登录完成后在页面找到信息查询—个人医保查询就能查询到城乡居民基本医疗保险个人缴费信息了。
4. 12333医保热线电话查询：使用12333医保热线电话进行查询。拨打电话后，根据语音提示选择相应的服务，输入个人身份信息，即可查询到扣费记录。

线下查询

1. 到当地的农村合作医疗管理部门或者社保局进行查询。您可以携带相关的身份证明和医保卡前往，向工作人员咨询并进行查询。
2. 到当地的农村医保经办机构（例如县社保局、乡镇卫生院等）查询，需要提供本人的身份证件或医保卡。

请注意，具体的查询方式可能会因地区而异。建议您在查询前先了解当地的具体查询方式和要求。