重庆大坪医院和西南医院的眼科各有优势，以下是对这两家医院眼科的具体比较：
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医疗团队
- 重庆大坪医院：眼科创建于1960年，经过多年发展，已成为集医疗、教学和科研为一体的综合性眼科。拥有医护技人员230余名，其中教授、副教授26人，医学博士25人。
- 西南医院：眼科始建于1929年，经过九十年的发展，形成了一支由教授、副教授、讲师、主治医生、博士后、博士、硕士组成的技术力量雄厚、学术梯队合理、医术精良、治学严谨的专业眼科医院（眼科专家和医生团队）。目前主系列人员49名，高级职称23人，博士生导师5名，留学经历的16名。
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医疗设备
- 重庆大坪医院：配备了国内最先进的眼科仪器设备，总值达5000万元，为眼科疾病的诊断和治疗提供了有力支持。
- 西南医院：引进了美国、德国、日本最先进的同视机、白内障超声乳化仪、鹰视酷眼准分子激光扫描系统和安全系数最高的板层刀及EPI-LASIK系统、玻璃体切割系统、多波长眼底激光和眼底影像系统等，设备总价值达四千多万元。
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科研成果
- 重庆大坪医院：在疑难复杂性青光眼的诊治、白内障手术治疗、超高度近视矫正手术及青少年近视防控等方面处于国内领先水平，历年来获得多项国家级、军队和重庆市科研成果奖。
- 西南医院：在国际上首次开展胚胎组织来源的RPC治疗视网膜变性临床试验，率先开展hESC-RPE细胞悬液移植治疗黄斑变性的临床试验，率先开展MSC静脉输注治疗糖尿病视网膜病变和视网膜色素变性临床试验等。近五年发表SCI论文109篇，单篇最高影响因子27.561。
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科室设置
- 重庆大坪医院：设有白内障、青光眼、屈光、眼底病内科、眼底病外科、斜视与小儿眼科、眼外伤、眼眶病及眼整形、眼表疾病、视光中心等十个特色专科，以及一个验光配镜中心和3000平米的门诊。
- 西南医院：分为门诊治疗区、屈光手术中心、视光中心、特殊检查区、住院部、实验室。占地面积近7000平方米，住院部开设病床120张，按疾病种类不同分为A、B、C三区。
两家医院的眼科都具备较高的医疗水平和专业能力，患者可以根据自己的实际情况和需求选择合适的医院就诊。