特殊人群不能自主缴费的原因是他们的医保费用是由政府或其他机构资助的。
根据相关政策,特殊人群的医保费用由相应的职能部门按规定给予资助。例如,丧失劳动能力的残疾人参加城乡居民医保所需个人缴费资金,由市残联为其全额代缴,个人不缴费。不同地区对于特殊人群的医保缴费有不同的规定和资助政策。例如,在西安,具有陕西省户籍的特殊人员可享受分类参保资助,特困人员、孤儿、事实无人抚养儿童无需个人缴费,低保对象、纳入监测范围的农村易返贫致贫人口、返贫致贫人口个人缴费90元。因此,当医保系统显示“特殊人群”时,意味着这部分人群不需要自行缴费,而是由相关部门代为缴纳。