南通治疗真菌性角膜炎推荐选择南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院等三甲医院，其中南通大学附属医院眼科为省级重点学科，拥有完善的诊疗设备和专家团队，尤其擅长角膜病等复杂眼病的综合治疗。
南通大学附属医院：作为南通地区综合实力最强的三甲医院，其眼科是江苏省“科教强卫工程”医学重点学科，拥有陈威等擅长角膜病治疗的专家团队，可开展角膜移植等复杂手术。医院配备先进的眼科检查设备，对真菌性角膜炎的早期诊断和个性化治疗经验丰富。
南通市第一人民医院：国家三级甲等综合性医院，眼科与南京医科大学等高校合作，临床科研能力突出。医院设有独立的眼表疾病诊疗中心，针对真菌性角膜炎的抗感染治疗和术后护理流程规范。
南通市中医院：作为三甲中医院，在结合中西医治疗角膜炎方面特色显著，如中药熏蒸、针灸辅助抗真菌治疗等。其眼科为市级重点专科，对反复发作的真菌感染有独特调理方案。
其他选择：南通市第三人民医院、海安市人民医院等也具备规范的角膜炎诊疗能力，适合轻症患者就近就医。
建议根据病情急重程度选择医院：急重症或需手术者优先考虑南通大学附属医院，慢性调理可选中医院。就诊前可通过医院官网或第三方平台查询专家坐诊时间，部分医院提供在线问诊服务。