农村合作医疗外省住院报销比例因多种因素而异，以下是一些常见的情况：
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有转诊证明的情况
- 按转诊医疗机构级别报销：如果参保人在参保地办理了异地就医备案，并且持有有效的转诊证明，在跨省定点医疗机构住院治疗，其报销比例通常与在参保地的报销比例相近。例如，在乡镇卫生院、县级医院、市级医院等不同级别的医院住院，会有不同的起付线和报销比例设定。一般来说，级别越低的医院，报销比例可能越高，起付线越低；级别越高的医院，报销比例可能相对较低，起付线较高。
- 部分地区的特殊政策：有些地区对于转诊到外省指定医疗机构的报销有特殊规定。比如，安徽省规定，跨省市外医院住院治疗的，按照市内医疗机构类别起付线增加一倍，报销比例降低 10%；若是未经转诊到外省住院治疗的，报销比例再降低 10%。
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无转诊证明的情况
- 统一报销比例：若未办理转诊手续或未按规定转诊到外地就医，在一些地区也有统一的报销比例规定。如某些地区的新农合政策规定，省外非定点医院起付线为 1000 元，报销比例为 45%。
- 不予报销或限制报销：部分地区对于未转诊直接去外省住院的情况，可能不予报销或只报销少量费用，以鼓励参保人员按照规定进行转诊。
农村合作医疗在外省住院的报销比例是一个复杂且多变的问题，它受到多种因素的影响。参保人员在就医前应仔细了解当地的医保政策，确保自己的权益得到最大化保障。