广东省内男科医院的排名，尤其是那些在泌尿外科和男科领域享有较高声誉的医疗机构，通常基于复旦版医院专科榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级和当地口碑等信息来评定。根据这些标准，以下几家医院在广州地区乃至整个广东省内被认为是治疗男科疾病最好的医院：
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中山大学孙逸仙纪念医院：该医院泌尿外科是中国泌尿外科发源地，在2019年发布的中国医院专科声誉排行榜中排名第五，华南第一。它还是国家临床重点专科、广东省医学重点学科，并且在肿瘤、微创、结石等多个亚专科达到了国内领先水平。
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中山大学附属第一医院：作为广东省高等院校重点学科，中山大学附属第一医院泌尿外科在肾上腺肿瘤的诊断和治疗方面技术达到了国内领先、国际先进水平。其在男性健康领域的研究和实践也得到了广泛认可。
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南方医科大学南方医院：这是一家拥有丰富经验的科室，同时也是广东省重点临床专科。南方医科大学南方医院不仅承担着医疗工作，还积极开展教学和科研工作，其专业水平无论是在临床疾病治疗还是基础研究方面均为国内领先水平。
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广州医科大学附属第一医院：这家医院是卫生部国家临床重点专科、广州市和广东省重点学科，也是广东省泌尿外科重点实验室的依托单位。其在前列腺疾病的微创治疗方面处于国内、国际领先地位。
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广东省人民医院：成立于1947年的泌尿外科是国内最早建立的泌尿专科之一。多年来，广东省人民医院凭借高超的医疗技术和高质量的服务水平为无数患者提供了优质的医疗服务。
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中山大学附属第三医院：泌尿外科是卫生部“国家临床重点专科”，广东省重点学科，以泌尿男生殖系肿瘤、前列腺疾病、泌尿系结石等亚专业特色明显而闻名。
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广州市妇女儿童医疗中心：虽然主要关注于妇女儿童健康，但其男科部门同样配备了先进的设备和技术力量，专注于不育症、男性生殖内分泌疾病等领域。
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南方医科大学珠江医院：作为广东及华南地区较大的泌尿外科中心之一，珠江医院泌尿外科承担了大量的医疗任务，并且是博士后流动站所在地。
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广州市第一人民医院：创建于1998年的男科，经过发展已经成为一个具有先进诊疗设备的专业科室，擅长男性性功能障碍的手术治疗。
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广州医科大学附属第二医院：泌尿外科自1973年成立以来，在微创和泌尿生殖系肿瘤方面一直处于华南地区的领先地位。
上述医院在男科疾病特别是泌尿外科领域都有着卓越的表现，无论是从学术研究、临床实践还是患者反馈来看，都是值得信赖的选择。选择哪家医院就诊，应根据个人具体情况（如病情类型、地理位置偏好等）来做决定。考虑到医疗技术和治疗方法的进步，建议定期查阅最新的医院排名和评价信息，以便做出最适合自己的就医决策。