阜阳医保在合肥中医院的费用报销比例，会因参保类型、就医人员类别以及是否备案等情况而有所不同，具体如下：
职工医保
- 异地长期居住人员：已办理异地安置退休、异地长期居住、常驻异地工作等医保备案的人员，在合肥中医院就医，职工医保起付标准、支付比例、最高支付限额等与阜阳市规定的本地就医标准一致。通常报销比例为门槛费以上至 3000 元报 88%，3000 - 5000 元报 90%，5000 - 10000 元报 92%，10000 元以上至最高支付限额内的报 95%，其中乙类药品按 80%，贵重药品按 70%，特殊检查和特殊治疗的按 70% 报销。
- 临时外出就医人员
- 省内异地就医：异地急诊和已办理转诊手续的，报销比例在阜阳市相同级别医疗机构基础上下降 5 个百分点；非急诊或未办理转诊的，下降 15 个百分点。
- 跨省异地就医：异地急诊抢救人员和已办理转诊手续的，报销比例在阜阳市相同级别医疗机构基础上下降 10 个百分点；非急诊或未办理转诊的，下降 20 个百分点。
居民医保
- 异地长期居住人员：办理异地就医备案后，在合肥中医院就医执行参保地规定的本地就医时的标准。具体报销比例为一级及以下医疗机构起付线 200 元，政策范围内报销比例 85%；二级和县级医疗机构起付线 500 元，政策范围内报销比例 80%；三级（市属）医疗机构起付线 700 元，政策范围内报销比例 75%；三级（省属）医疗机构起付线 1000 元，政策范围内报销比例 70%。
- 临时外出就医人员
- 省内异地就医：以省立医院为例（省属三级医院），起付线 2000 元，政策范围内报销比例为 55%。
- 省外异地就医：以北京 301 医院为例（省外三级医院），起付线按当次住院总费用 20% 计算，不足 2000 元的按 2000 元计算，最高不超过 1 万元，政策范围内报销比例为 50%。