南京医保参保人员在上海市就医时，是否可以报销取决于具体的情况和是否办理了相关手续。以下是详细说明：

1. 异地就医报销政策概述

根据南京医保政策，异地就医的报销分为两种情况：

• 住院费用：已办理异地就医备案的参保人员，在上海住院的费用可以按照南京医保政策报销。
• 门诊费用：南京医保参保人需满足特定条件，才能在上海直接刷卡结算门诊费用。

2. 报销条件

（1）住院费用报销

• 备案要求：参保人员需提前办理异地就医备案手续，包括填写《基本医疗保险转外就医备案表》，并由南京市三级医院主任医师签署转诊意见，经医院医保办公室审核盖章后，再到市、区社保经办机构办理备案。
• 报销范围：参保人员在备案后，住院费用可以按照南京医保政策报销，包括起付标准和乙类药品、诊疗项目、服务设施的个人自付部分，其余费用由统筹基金和个人共同分担。

（2）门诊费用直接结算

• 政策支持：从2019年起，南京医保参保人员因“异地安置、长期居住、长期工作或学习、转外就诊”等原因，办理备案后，可在上海市接入“长三角三省一市”异地就医门诊结算系统的医院直接刷卡结算门诊费用。
• 必备条件：
  1. 办理上海市的异地就医备案登记手续。
  2. 持有江苏省社会保障卡（简称“省卡”）。
  3. 就诊医院已接入“长三角三省一市”异地就医门诊结算系统。

3. 备案流程

• 异地就医备案：
  1. 凭身份证和转诊证明，向南京市三级医院医保办公室或市、区社保经办机构申请并填写《基本医疗保险转外就医备案表》。
  2. 经审核盖章后，到市、区社保经办机构完成备案。
• 办理省卡：备案后，凭身份证和备案表，到市、区社会保障卡服务网点办理江苏省社会保障卡。

4. 注意事项

• 未备案的情况：如果未按规定办理异地就医备案手续，直接到上海就医，报销比例会降低20个百分点。
• 急诊情况：因突发急、危、重病抢救或急诊治疗，可提供急诊诊断证明（或急诊病历），报销比例不会降低。

5. 总结

• 南京医保参保人员在上海市就医，住院费用需提前办理备案手续后才能报销；门诊费用在满足特定条件下可直接刷卡结算。
• 建议根据自身需求提前办理备案手续，并确保符合报销条件，以避免影响报销比例。

如需进一步了解具体操作或政策详情，可参考南京市医保局的官方信息或咨询相关经办机构。