根据江苏省医疗保障政策，连云港医保在南京看病能否报销需根据具体情况判断，具体说明如下：
一、直接使用连云港医保卡的情况
- 私立医院
连云港医保卡无法直接在南京的私立医院使用，国家医保仅覆盖公立医院。
- 转诊手续
若需在南京的公立医院就医，必须办理异地转诊手续并持有转诊证明。但根据搜索结果，连云港与南京尚未实现医保异地联网，即使办理转诊，医保仍无法直接结算。
二、报销流程与条件
- 报销前提
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需在南京的定点公立医院就医；
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办理异地转诊手续（未办理则报销比例降低20个百分点）。
- 报销比例
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转诊后报销比例通常比市内降低5个百分点（如市内60%则转诊后为55%）；
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若未办理转诊，报销比例降低20个百分点。
- 报销材料
需携带身份证、医保卡、就医发票、费用明细清单、转诊证明等材料，到连云港医保部门申请报销自费部分。
三、其他注意事项
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异地就医备案 ：建议通过连云港医保官方渠道办理异地就医备案，确保符合备案条件；
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费用结算方式 ：医保仅报销合规医疗费用，自费部分需先行垫付，回连云港后通过医保报销。
四、补充说明
- 南京本地医保 ：若南京当地医保已参保，其医保政策与连云港无直接关联，需按南京医保规定报销。
综上，连云港医保在南京看病无法直接使用，需通过转诊手续并符合条件申请报销，且报销比例可能降低。建议提前联系连云港医保部门确认最新政策。