新型农村合作医疗（新农合）由卫生行政部门负责管理
新型农村合作医疗制度是为解决农村居民看病就医问题而建立的一项基本医疗保障制度，主要由各级卫生行政部门内部设立的专门农村合作医疗管理机构负责具体工作。省、地级人民政府还成立由卫生、财政、农业、民政等多部门组成的农村合作医疗协调小组以支持其运行。
（一）新农合的组织架构与职责划分
卫生行政部门主导 卫生行政部门在新农合制度中扮演核心角色，负责统筹规划和日常管理工作，包括定点医疗机构的准入、监管及动态调整等。
财政部门提供资金保障 财政部门需确保补助资金落实到位，并将其纳入年初预算，以保障新农合工作的顺利推进。
其他相关部门协同配合 农业、民政、扶贫等部门也参与其中，共同推动新农合政策落地实施。
部门 | 主要职责 |
|---|---|
卫生行政部门 | 统筹管理、制定政策、监督执行 |
财政部门 | 提供资金支持并监督使用 |
民政部门 | 协助困难群体参保及救助 |
农业部门 | 支持基层医疗服务体系建设 |
（二）新农合的具体实施机制
省级及以下机构分工明确 各省份根据实际情况设立相应管理机构，通常不增加编制，依靠现有资源完成任务。
定点医疗机构动态监管 由同级卫生行政部门确定新农合定点医疗机构，并通过严格的准入与退出机制进行动态监管。
跨省转诊结算管理 对于新农合交由其他部门管理的省份，仍需承担省外患者的结报和结算管理工作。
（三）政策背景与发展目标
政策依据 新农合制度是党中央、国务院为解决农村居民看病就医问题而建立的基本医疗保障制度，体现了构建社会主义和谐社会的战略部署。
年度重点工作推动 每年相关部门都会发布通知，明确新农合的重点工作任务，例如2012年的深化医改相关要求。
长期发展目标 通过不断优化管理和服务，巩固和发展新农合制度，实现全民健康覆盖的目标。
新农合医疗制度作为一项重要的公共卫生政策，其管理主体明确，涉及多个政府部门的协作。通过持续改进，这一制度不仅提高了农村地区的医疗服务可及性，也为实现全民医保奠定了坚实基础。