农村合作医疗的报销方式主要包括以下几种：

1. 直接刷卡报销 ：

• 参保患者凭有效证件和医疗卡在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可直接刷卡报销。

• 在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结账时也可直接刷卡报销。

2. 窗口报销 ：

• 对于在市外二级及以上公立医院住院治疗的参保患者，应在出院后的3个月内，携带相关医疗费用原始发票、住院医疗费用汇总明细清单、出院小结、门诊病历、医疗卡、患者身份证、户口簿及经办人身份证，到区行政服务中心新农合窗口报销医药费用。

3. 特殊病种门诊报销 ：

• 参保患者若需特殊病种门诊报销，可持二级及以上定点医疗机构出具的病例及相关检查、化验报告、医疗机构证明书等资料，以及《新型农村合作医疗特殊病种门诊治疗审批表》，向新农合业管中心提出申请。经审核批准后，其门诊医药费用可列入新农合基金的报销范围，按住院报销标准以年度为单位进行报销。

4. 意外伤害住院报销 ：

• 因意外伤害的住院患者，出院后需提交由户口所在村（居）签字盖章的意外伤害引发的原因确认证明及医院的病案记录。

5. 现金缴纳 ：

• 农村居民可以直接到指定的缴费点进行现金缴纳，这是最为传统和直接的缴费方式。

6. 银行转账 ：

• 农民可以通过手机APP、官方网站等途径进行缴费，这种方式操作简便、速度快。

7. 医院直接报账 ：

• 因疾病住院办理住院手续时，向医院出具新型农村合作医疗证直接参与报账。

8. 镇新型农村合作医疗办公室报账 ：

• 报账材料由个人拿到新型农村合作医疗办公室，由镇农医办呈报县农医办报账之后，由镇农医办电话通知前来领取报销费用。

9. 异地就医报销 ：

• 参保人员可以前往定点医疗机构办理报销手续，经确认身份后，可直接刷卡报销。符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，可以由基本医疗保险基金进行报销。法律依据为《中华人民共和国社会保险法》。

10. 大病保险报销 ：

• 农村居民在享受基本医疗保险报销后，如果个人自付的医疗费用超过一定金额，还可以享受大病保险报销。大病保险的报销比例和报销限额根据地区政策而定。

11. 生育医疗待遇 ：

• 农村居民中的育龄妇女在生育时，符合规定的生育医疗费用也可以通过农村合作医疗报销。

建议：

• 参保患者在住院治疗时，应提前了解并确认相关报销流程和所需材料，以确保顺利报销。

• 对于市外就医的患者，建议提前办理好转诊手续，并咨询当地社保部门，了解异地就医的具体报销政策和流程。