农村合作医疗卡里的400元可能因为以下原因而减少或消失：
1. 用于支付医疗费用
门诊费用：如果你在定点医疗机构就诊，使用农村合作医疗卡支付了门诊费用，卡里的钱会相应减少。例如，你在村卫生室看病，花费了100元，报销比例为60%，那么你实际支付40元，卡里的钱会减少40元。
住院费用：住院治疗时，农村合作医疗卡也会用于支付部分费用。比如，你在二级医院住院，总费用为10000元，起付线为400元，报销比例为75%，那么你需要支付的费用为（10000-400）×（1-75%）=2400元，卡里的钱会相应减少。
2. 账户清零或划转
年度清零：农村合作医疗的资金每年都会清零，这是因为当年交纳的医保费用只享受当年的医保待遇。如果在一年内没有使用完卡里的钱，到年底就会被清零。
划转至门诊统筹：部分地区的新农合已经改革，全面实行门诊统筹，个人账户的资金可能会被划转到门诊统筹账户中。例如，你缴纳了400元，其中一部分可能被划转到门诊统筹账户，用于提高整体的医疗报销比例。
3. 政策调整
缴费标准变化：新农合的缴费标准可能会根据政策调整而变化。例如，2024年新农合的缴费标准为每人每年400元，如果之前缴费标准较低，那么在调整后，你需要补缴差额部分。
取消个人账户：部分地区已经取消了新农合的个人账户，将资金统一划转到社会统筹账户中。在这种情况下，卡里的钱会被清零或划转。
4. 系统错误或异常
系统故障：医保系统的故障或异常可能导致卡里的钱被错误地扣除或清零。例如，系统升级或维护时，可能会出现数据错误，导致卡里的钱减少。
误操作：在使用农村合作医疗卡时，如果操作不当，如输入错误的金额或选择了错误的支付方式，也可能导致卡里的钱被错误地扣除。