异地就医时农村医保不能报销通常不是因为政策不允许，而是可能在就医过程中出现了一些问题，以下是具体原因：
未进行异地就医备案
备案的重要性：异地就医备案是农村医保报销的前提条件。备案后，医保系统能够识别参保人的异地就医身份，从而按照相关政策进行费用结算。
备案的方式和时间：参保人可以通过微信小程序、异地就医备案APP等方式进行备案，也可以到当地医保经办机构办理。建议在就医前尽早完成备案，避免因备案不及时影响报销。
就医医院未纳入定点医疗机构范围
定点医疗机构的定义：定点医疗机构是指与医保部门签订了服务协议，能够为参保人员提供医疗服务的医疗机构。
选择定点医疗机构的必要性：只有在定点医疗机构就医，才能享受医保报销待遇。如果在非定点医疗机构就医，医保部门无法核实医疗费用的合理性和真实性，因此不能报销。
费用结算方式不正确
直接结算和手工报销：异地就医费用结算方式主要有两种，一种是直接结算，另一种是手工报销。直接结算需要就医地和参保地的医保系统互联互通，且就医医院具备直接结算功能。
结算方式选择的重要性：如果参保人未选择正确的结算方式，或者因结算网络系统、就诊凭证等故障导致无法直接结算，需要回参保地手工报销。
医保目录差异
医保目录的定义：医保目录是指医保部门规定的可以报销的药品、诊疗项目和服务设施范围。
目录差异的影响：不同地区的医保目录可能存在差异，如果参保人在异地就医时使用的药品、诊疗项目等不在参保地的医保目录内，就不能报销。
报销政策差异
不同地区的报销政策不同：不同地区的农村医保报销政策可能存在差异，包括报销比例、起付线、封顶线等。
政策差异的影响：如果参保人对异地就医的报销政策不了解，可能会导致报销金额低于预期，甚至无法报销。