皮肤细菌感染和真菌感染的区别分别包括致病菌不同、引起的疾病不同、临床表现不同等方面不同。
1、致病菌不同：皮肤细菌感染的常见致病菌为金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、链球菌等；而真菌感染的致病菌通常为念珠菌感染、毛癣菌感染、霉菌感染等。
2、引起的疾病不同：细菌感染可引起疖、痈等皮肤疾病；而真菌感染引起的疾病有手足癣、体癣、甲癣、头癣等。还有毛囊炎的皮肤病均可由细菌感染或者真菌感染引起。
3、临床表现不同：细菌感染引起的皮肤病主要是以局部红、肿、热、痛为主要症状，甚至有时会伴随发热、恶心、食欲不振等全身症状，而真菌感染主要以皮肤症状表现为主，比如引起红斑、脱皮、皮肤瘙痒、丘疹等症状。
皮肤细菌感染和真菌感染除了上述有区别之外，由于疾病类型不同，所以使用的药物也会有所不同，细菌感染者一般以抗生素治疗为主，而真菌感染者，主要使用抗真菌的药物治疗。具体的用药情况，应结合自身情况，在医生指导下采取对症的用药处理。