怀孕六周测早孕试纸颜色不如原来深可能是孕囊发育不好，也可能是检测时操作失误，具体如下：

1.孕囊发育不好：早孕试纸测试主要是检测尿液中人绒毛膜促性腺激素（HCG），属于定性试验，即无法检测出HCG的具体含量，只能通过颜色变化来判断阴阳性。一般来说，孕6周时HCG大量分泌，孕9-11周HCG达到最大值，之后逐渐下降。因此孕6周试纸阳性颜色不如之前的深，要警惕是否是孕囊发育不好，孕囊发育不好会影响HCG的分泌量，从而导致尿液中含量减少，测试时就会出现试纸强阳变弱阳的情况。一般需要定期就医检查，观察胎儿发育情况，若胎儿胎心胎芽正常，且没有发育异常的问题，可不必治疗，平时多注意休息，避免过度劳累；若确诊胎停要考虑尽早清宫治疗。

2.检测操作失误：如选取过期或受潮的试纸进行测试；测试时间不对，一般早晨尿液中 HCG值较晚上高；检测时尿液未浸没试纸的长度，这些均能影响早孕试纸的准确度。因此，应严格遵照早孕试纸说明书要求进行检测。

此外，如果是多胞胎或葡萄胎，尿中HCG浓度太高，会影响试纸的灵敏度，也可能出现强阳变弱阳的情况。

因此，当确诊怀孕，再使用早孕试纸意义不大，应通过化验血HCG、B超等相关检查来判断胎儿发育情况。