显微镜根管治疗是现代牙体牙髓治疗的非常巨大的发展，因为可以把牙齿的微观系统，用放大十倍或者四十倍的程度，把牙齿的内部结构看得非常清楚。显微镜的根管治疗步骤和根管治疗的步骤没有什么大的差异，包括根管预备、根管消毒或者是根管充填，基本的步骤都是一样的。包括最开始的临床检查，以及后面的在局麻下的根管治疗，包括在局麻之后的测长、根管预备、根管消毒、冲洗以及根管的充填的步骤都是一样的。只是所有的步骤是要在口腔显微镜下，也就是放大的视野下，非常的清楚完成根管治疗的步骤。
但是如果只要了使用了显微镜，都是因为根管的解剖系统和正常的根管解剖系统出现变异的时候，或者是根管治疗过程中和常规根管治疗，觉得通路被阻塞的时候。例如有钙化的情况，还有是随着根管预备器械机用器械，也就是根管清创的器械的不断发展，有时候在治疗过程中不可避免器械可能会折断在根管内，这时候就必须利用显微镜来进行疑难根管的治疗的处理。总之显微镜下的根管治疗的基本步骤和正常的不用显微镜步骤是基本一致的，但是对于疑难根管，像钙化根管、根管内有异物或者寻找缺失的根管的时候，对这些疑难根管处理的时候，要在显微镜下才能达到非常好的治疗效果。
