科室备有电子胃镜，可以进行相关的检查及胃镜下食管狭窄扩张、支架置放及食管异物取出等治疗。
胸外科专门研究胸腔内器官，主要指食道、肺部、纵隔病变的诊断及治疗，乳腺外科领域也被归入这个专科，其中又以肺外科和食道外科为主。胸外科已经分化为普通胸外科、心脏外科、大血管外科以及小儿心脏外科等。
胸外科专门研究胸腔内器官，主要指食道、肺部、纵隔病变的诊断及治疗，乳腺外科领域也被归入这个专科，其中又以肺外科和食道外科为主。胸外科已经分化为普通胸外科、心脏外科、大血管外科以及小儿心脏外科等。
济南军区总医院胸外科科室以食管外科、肺外科和以胸腔镜技术为代表的微创外科为学科重点，形成了自己的特色和优势。在食管外科方面：改进和完善了食管癌的系列手工和器械吻合技术，特别是左侧开胸食管床内食管胃弓上手法和器械吻合的应用，有效地预防了吻合口瘘等术后严重并发症的发生；