江西九江在治疗流行性角结膜炎方面，有多家医院具备较好的口碑和专业实力。以下是根据搜索结果整理的排名信息：

九江市第三人民医院

• 特色：由原三医院和原传染病医院合并组建而成，以肿瘤诊疗、肝病诊疗、结核病诊疗和急性传染病诊疗为专科特色。
• 传染科实力：医疗设施齐全，在传染科疾病治疗方面经验丰富。

都昌县中医院

• 口碑：传染科口碑良好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
• 中医特色：在中医方针政策的指引下发展，具备一定的眼科常见病、多发病的治疗水平。

九江市妇幼保健院

• 历史：始建于1896年，前身为美国基督教卫理公会创建的“但福德”医院。
• 综合实力：作为一所综合性医院，在多个医疗领域都有较强的实力。
• 中医治疗：结合中医治疗手段，为患者提供多样化的治疗方案。

九江学院附属医院

• 眼科中心：九江及周边地区眼科疾病诊疗中心，疑难疾病的治疗中心。
• 科研能力：眼科十分重视科研工作，在眼科学的基础和临床应用方面取得较大突破。

中国人民解放军第171医院

• 教学医院：现为九江学院、南昌大学等5所医学院校的教学医院。
• 眼科专长：熟悉眼科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗屈光不正、结膜炎、角膜炎等方面具有显著优势。

请注意，医院的排名可能会随时间发生变化，建议您在就诊前通过电话或网络与医院联系，确认最新的门诊时间和医生排班信息。希望以上信息能帮助您找到合适的医院，及时治疗流行性角结膜炎。