上海住院后社保报销流程及注意事项如下：

一、报销流程

1. 就医时结算

   • 出院时直接结算：持社保卡在定点医疗机构结算，个人自付部分由医保和医院直接扣除，无需垫付。

   • 需提前备案：异地就医需通过"国家医保服务平台"APP或窗口备案上海定点医疗机构。

2. 提交报销材料

   • 必备材料：住院医疗费专用收据、住院医疗费清单、出院小结（急诊除外）、医保卡等。

   • 额外材料：外省市急诊住院需用人单位证明，灵活就业人员需身份证原件。

3. 审核与支付

   • 15个工作日内完成审核，报销金额划入医保账户，个人自付部分由医保卡余额和现金支付。

   • 需携带《医疗报销计算表》到社保局窗口领取（可妥善保管）。

二、报销比例

1. 起付标准

   • 城镇职工医保：首次住院1300元，后续650元。

   • 城乡居民医保：市级医疗机构起付标准以上部分按不低于60%报销。

2. 医院等级差异

   • 三级医院：在职人员85%，退休人员91%；二级医院80%，三级医院70%。

   • 城乡居民医保：学生/儿童在三甲医院18万元以下部分报销比例逐级递减（一级65%，三级50%）。

三、注意事项

1. 起付线与封顶线

   • 城镇职工医保起付线1300元，最高支付限额46万元；城乡居民医保起付线根据医院等级和年龄浮动，最高支付限额51万元。

2. 异地就医限制

   • 需提前备案上海定点医疗机构，急诊或特殊情况下可先垫付后报销。

3. 报销时效

   • 一般需在15个工作日内完成审核，逾期不予处理。

四、特殊情况处理

• 未备案或直接结算失败 ：需先垫付费用，回参保地医保申请报销，报销比例与上海本地一致。

• 附加基金适用 ：超过最高支付限额部分，由附加基金按80%支付，个人自负20%。

总结 ：上海住院医保报销流程便捷，建议提前备案并妥善保存就医材料。不同医保类型和医院等级存在差异，需根据实际情况选择合适方案。