深圳二档医保参保人在东莞三甲医院就医时，可以报销部分医疗费用，但需满足特定条件。以下是详细说明：

1. 报销范围

• 深圳二档医保参保人住院就医时，可在广东省内定点医疗机构直接结算，包括东莞的三甲医院。
• 普通门诊方面，目前政策未明确支持在东莞三甲医院直接报销，但参保人需先绑定深圳市内的社康中心或其他基层医疗机构，才能享受门诊统筹待遇。

2. 报销比例

• 住院费用：深圳二档医保参保人在东莞三甲医院就医，住院费用可按政策报销，三级医院报销比例为55%。
• 普通门诊费用：若符合门诊统筹条件，报销比例根据医院等级有所不同，三级医院为55%，二级医院为65%，一级及以下为75%。

3. 注意事项

• 绑定医疗机构：普通门诊需绑定深圳市内社康中心，若未绑定，则无法享受门诊统筹待遇。
• 异地就医备案：若在东莞三甲医院就医，建议提前办理异地就医备案，以便直接结算。
• 年度限额：门诊年度支付限额为深圳市上上年度在岗职工年平均工资的1.5%（约2333元），超过部分需个人承担。

4. 建议

• 如需在东莞三甲医院就医，建议提前确认是否已绑定深圳市内医疗机构，并办理异地就医备案。
• 详细政策可咨询深圳市医疗保障局或东莞当地医保部门，确保报销权益。

通过合理规划，深圳二档医保参保人可以在东莞三甲医院享受医保报销服务，但需满足特定条件和政策要求。