药店申请医保定点资格的流程可分为以下步骤，综合多个权威信息源整理如下：
一、申请资格要求
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基本资质
需具备《药品经营许可证》《营业执照》等有效证件，且营业执照需与法人身份证保持一致。
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经营条件
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正常经营满1年（部分地区可能要求3个月）；
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药品价格政策需符合国家/省级规定，且通过物价部门监督检查；
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营业场所需符合药品经营质量管理规范要求。
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二、申请材料准备
需提交以下材料：
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基础文件
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药店法人身份证原件及复印件；
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营业执照、药品经营许可证原件及复印件；
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医保刷卡申请表（需填写完整）。
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补充文件
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非法定代表人需提供授权委托书及代办人身份证；
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药品库存清单、财务报告等辅助性文件。
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三、申请流程
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提交申请
将材料提交至当地医保部门或指定机构，确保材料齐全、装订规范（A4纸国际标准装订）。
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审核评估
医保部门通过书面审核和现场察看（如药品库存、环境设施、人员资质等）评估药店是否符合要求。
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结果公示
审核结果会在医保部门官网或微信公众号公示，接受社会监督。
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签订协议
审批通过后，与医保部门签订《医疗保障定点服务协议》，明确双方权利义务。
四、后续事项
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医保POS机安装
完成协议签订后，需安装医保POS机并完成银行账号绑定，方可启用医保刷卡功能。
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持续合规
需定期接受医保部门的监督检查，确保药品采购、销售、结算等环节符合医保政策。
注意事项
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不同地区具体流程和材料要求可能有所差异，建议提前咨询当地医保部门；
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若申请未通过，需根据反馈意见整改后重新提交。
（综合来源：）