肺芽生菌病在治疗后可能会有后遗症，主要包括以下几种情况：
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肺部结构改变
- 肺纤维化：肺芽生菌病会导致肺部炎症和损伤，在病情恢复过程中，肺部组织可能会进行修复，但这种修复可能不完全，导致肺部纤维组织增生，形成肺纤维化。肺纤维化会影响肺部的正常功能，使肺部变得僵硬，气体交换能力下降，患者会出现呼吸困难、干咳、乏力等症状，且这些症状会逐渐加重。严重的肺纤维化甚至可能导致呼吸衰竭，危及患者生命。
- 肺气肿：部分患者在肺芽生菌病治愈后可能会出现肺气肿的后遗症。这可能是由于肺部炎症对肺泡结构的破坏，以及在治疗过程中使用的一些药物或治疗方法对肺部的影响等因素导致的。肺气肿会使肺泡过度充气，肺泡壁破裂，从而影响气体交换，导致患者出现气短、气促、咳嗽等症状，尤其是在活动后症状会更加明显。
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呼吸道功能受损
- 支气管扩张：肺芽生菌病引起的肺部炎症可能会累及支气管，导致支气管壁的肌肉和弹性组织受损，使支气管变形、扩张。支气管扩张后，容易积聚分泌物，不易排出，容易反复发生感染，患者会出现咳嗽、咳大量脓痰、咯血等症状，严重影响患者的生活质量。
- 通气功能障碍：由于肺部的病变和结构改变，患者的肺通气功能可能会受到损害。通气功能障碍会导致患者在呼吸时气体交换不足，身体缺氧，出现呼吸困难、胸闷、乏力等症状。在进行体力活动时，这些症状会更加明显，严重限制了患者的运动能力和日常活动。
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其他器官受累
- 胸膜粘连：在肺芽生菌病的治疗过程中，如果炎症累及胸膜，可能会导致胸膜粘连。胸膜粘连会使患者在呼吸时感到疼痛，尤其是在深呼吸或咳嗽时疼痛会更加明显。胸膜粘连还可能影响肺部的正常扩张和收缩，进一步影响呼吸功能。
- 心脏受累：严重的肺芽生菌病可能会影响心脏功能。肺部的病变会导致肺部血管阻力增加，使右心负担加重，长期下去可能导致右心衰竭。右心衰竭会引起体循环淤血，患者会出现水肿、肝大、颈静脉怒张等症状。
肺芽生菌病治疗后可能存在多种后遗症，包括肺部结构改变如肺纤维化、肺气肿，呼吸道功能受损如支气管扩张、通气功能障碍，以及其他器官受累如胸膜粘连、心脏受累等。这些后遗症会对患者的身体健康和生活质量造成不同程度的影响，因此对于肺芽生菌病应尽早诊断、积极治疗，并密切关注病情变化，以减少后遗症的发生。