小儿手-心畸形综合征的形成涉及多因素共同作用，主要包括以下机制：

一、遗传因素

1. ‌常染色体显性遗传‌
   该病具有明确家族史，后代发病概率约50%‌。致病基因突变可同时影响心血管系统及上肢骨骼发育，但携带上肢畸形基因的个体不一定合并心脏病变‌。
2. ‌染色体异常‌
   少数病例存在第16对染色体微小变异，但多数患者核型正常‌。染色体数目异常（如三体）或结构异常（缺失/重复）可能干扰胚胎早期器官分化‌。

二、胚胎发育异常

1. ‌胚胎第4周关键期干扰‌
   上肢芽与心脏原始分化均在此阶段完成，导致两者易受同一致畸因素影响。桡侧骨骼因胚胎发育时序更早，易出现发育不良或缺失‌。
2. ‌组织分化异常‌
   心脏发育异常以房间隔缺损（70%）、室间隔缺损最常见，上肢畸形特征性表现为拇指发育异常（半脱位、三节指骨）及桡骨缺如‌。

三、环境致畸因素

1. ‌药物暴露‌
   妊娠早期（尤其第1个月）使用抗癫痫药物显著增加发病风险‌。
2. ‌感染与毒素‌
   孕期感染风疹病毒、巨细胞病毒，或接触辐射、化学物质（如有机溶剂）可破坏胚胎正常发育‌。
3. ‌母体疾病‌
   未控制的糖尿病、甲状腺功能异常等代谢疾病可能通过干扰胎盘功能间接导致畸形‌。

四、多因素交互作用

目前认为该病是遗传易感性与环境触发因素共同作用的结果。携带致病基因的胚胎在药物、感染等外因刺激下，易发生心脏-上肢同步发育障碍‌。

注：产前超声联合基因检测可早期识别高风险胎儿，孕前遗传咨询及孕期规避致畸因素有助于降低发病率‌。