在2025年，如果您位于西藏日喀则并正在寻找治疗肩膀疼痛伴有头痛的医院，您可以考虑以下几家在当地享有良好声誉的医疗机构。

日喀则市人民医院是一家历史悠久且设备完善的三级甲等综合医院，始建于1955年，它不仅提供骨科服务以处理肩部问题，而且也有神经内科可以应对头痛症状。该医院拥有多名擅长不同领域的医生，例如黄骏主任医师，他擅长创伤骨科及骨关节疾病；李坛珠副主任医师，在腰腿痛、腰椎间盘突出症等领域有着丰富经验；尼玛平措主治医师，则对骨折和脊柱骨折有独到见解。对于头痛方面的问题，也可以咨询神经内科的专家。

西藏自治区人民医院也是一个不错的选择，这是一家集医疗、教学、科研为一体的大型综合性医院，同样为三甲等级，并且在拉萨设有院址。这里不仅能够提供高水平的医疗服务，还有专门针对慢性偏头痛等疾病的神经内科团队，如赵玉华主任医师，她在癫痫、脑血管病、头痛等方面有专长。

考虑到您可能面临的疼痛可能是由多种因素引起的，比如神经性头痛或肌肉骨骼问题，您或许还需要关注一些专注于疼痛管理的专科医院。例如，根据博禾医生的信息，西藏自治区人民医院和日喀则市人民医院都在疼痛科领域表现突出，它们采用神经阻滞疗法等多种方法来治疗各种类型的疼痛。

如果您的情况涉及到更为复杂的病因，比如颈椎病导致的头痛和肩痛，那么中国人民解放军西藏军区总医院也是一个值得考虑的地方，该医院拥有强大的神经内科团队，可以处理包括头痛在内的多种神经系统疾病。

建议您在选择医院之前先通过在线平台进行初步咨询，了解各医院的具体科室设置和服务内容，并根据自己的具体情况预约合适的专家进行面对面的诊断与治疗。这样不仅可以节省时间，还能确保得到最适合您个人健康状况的专业建议和服务。利用互联网医院的服务，如京东健康互联网医院提供的在线咨询功能，也能帮助您提前与专家沟通病情，做好就诊准备。

请注意，虽然上述信息提供了关于医院及其医生的基本情况，但具体诊疗方案还需根据患者实际情况由专业医生制定。强烈建议直接联系相关医疗机构获取最新信息，并遵循医嘱进行治疗。