一般来说，秸秆补贴可以向当地的农业农村部门申请。以珠海市为例，具体情况如下：

• 省级项目申报：若申请省级相关秸秆综合利用项目补贴，根据 2023 年广东省农业农村厅发布的《关于做好 2023 年中央农业资源及生态保护补助资金 —— 农作物秸秆综合利用项目申报入库的通知》，申报单位需通过广东省农业农村厅专项资金管理系统进行网上申报，网址为http://120.197.34.35:8001/nytzj - web/minstone/login。有关县（市、区）项目申报材料由地级以上市农业农村局汇总并审核，确认资料合规后，出具正式文件并在系统审核通过，予以上报。书面材料则由各地级以上市统一报送至省农业农村投资项目中心。
• 市区级情况：目前未查到珠海市有专门针对秸秆补贴的市区级政策文件及明确申请部门。但涉及农业补贴相关事宜，通常由珠海市农业农村局及各区农业农村行政主管部门负责管理和指导。例如，在粮食生产补贴等相关政策中，各区农业农村行政主管部门承担着公开奖补信息、核实抽查等工作。

不过，由于秸秆补贴政策在不同地区可能存在差异，建议你进一步关注珠海市及所在区的农业农村局官方网站，或直接咨询当地农业农村部门，以获取准确的申请信息。部分地区的财政部门也会参与秸秆补贴的相关工作，如资金分配、管理和监督等，也可向他们了解相关情况。