东莞异地医保备案办理流程如下：
线上办理
可通过 “粤医保” 微信小程序、“国家医保服务平台” APP、“粤省事” 微信小程序办理。具体如下：
- “粤医保” 微信小程序
- 微信搜索 “粤医保” 并关注，进入 “线上办理 -> 异地就医备案” 中的登记界面。
- 如实完整地录入相关信息并上传申报材料。
- 申报提交成功后，可在 “我的” 里面查询进度及结果，审核通过的，可在 “备案信息查询” 或 “我的权益”->“我的备案” 中查看详细备案信息。
- “国家医保服务平台” APP
- 仅限长期异地跨省备案，手机下载 “国家医保服务平台” APP，进入 “在线办理 -> 异地备案 -> 异地就医备案申请”。
- 在异地就医备案申请界面如实完整地录入相关信息并上传申报材料。
- 申报提交成功后，可在 “在线办理 -> 异地备案 -> 备案记录” 里面查看进度及结果。
- “粤省事” 微信小程序
- 微信搜索 “粤省事” 并关注，进入粤省事医保区域后，进入 “就医保障 -> 异地就医 -> 异地就医备案登记”。
- 如实完整地录入申请信息并上传相关资料。
- 申报提交成功后，可在粤省事微信小程序 “就医保障 -> 异地就医 -> 省内 / 出省、来粤异地就医备案信息” 里查询进度及结果。
电话（传真）办理
拨打经办机构电话，传真相关备案资料，待经办机构审核通过后，参保人可通过电话传真接收相应的备案表。
窗口办理
- 申请：参保人通过现场方式提出申请，按要求提交纸质申请材料。
- 受理：工作人员收到申请材料之日起即时做出受理或不予受理决定。经审查，参保人符合申请资格，且材料齐全、格式规范、符合法定形式的，予以受理；参保人因不符合申请资格的，不予受理；材料不齐全、格式不规范、不符合法定形式的，一次性告知参保人需补充的全部内容，待补正后再予受理。
- 审查：受理后，审查人员对材料进行书面审查，即时办结，如有特殊情况的，在承诺办理时限内作出批复。
- 办结：参保人符合法定资格、标准且材料齐全、格式规范、符合法定形式的，准予通过，出具相应的备案表交参保人；参保人不符合法定资格的，不予通过，告知参保人不予批复原因；材料不齐全、格式不规范、不符合法定形式的一次性告知参保人需补充的材料。
不同的备案类型所需材料有所不同。如异地长期居住人员需提供户口簿首页和本人常住人口登记卡或居住证，或者《基本医疗保险异地就医备案个人承诺书》等；常驻异地工作人员需要参保地工作单位派出证明、异地工作单位证明、工作合同任选其一或《基本医疗保险异地就医备案个人承诺书》等；异地转诊人员则需要《广东省异地就医登记备案表》、备案地转出医院转院证明原件等。