东莞社保在深圳住院报销情况需分情况来看，具体如下：
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办理异地就医备案
- 若参保人提前通过线上或线下渠道成功办理了异地就医备案手续，那么在深圳的定点医院住院时，可直接使用东莞社保进行结算，按照东莞当地的医保政策享受相应的报销待遇。一般来说，报销比例会根据不同的医院等级有所不同，通常在东莞本地，一级医院起付线为500元，报销比例为95%；二级医院起付线为800元，报销比例为90%；三级医院起付线为1300元，报销比例为85%。但在深圳的具体报销比例可能会因两地医保政策的衔接和具体规定有所差异。
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未办理异地就医备案
- 自行垫付后回东莞报销：参保人在深圳住院后需要先个人垫付全部医疗费用，然后在出院后的一定时间内（通常是一年内），携带相关资料回东莞的社保经办机构办理报销手续。所需资料一般包括居民身份证、医院收费票据（需医院盖章）、住院费用清单（需医院盖章）、诊断证明、千元以上医用材料产地（国产/进口）证明（使用千元以上的医用材料需提供，且需医院盖章）、东莞市社会医疗保险意外伤害受伤经过确认书（申请伤害情形的费用报销需填写）等。
- 报销比例降低：未办理异地就医备案的情况下，报销比例会相应降低。一般情况下，在市内非定点医院或市外定点医院住院的基本医疗费，统筹基金各段支付比例均减少15%；未经核准自行到市外非定点医疗机构住院的基本医疗费，统筹基金各段支付比例均减少30%。
东莞社保在深圳住院能否报销以及报销比例多少，取决于是否办理了异地就医备案以及所选择医院的定点情况。建议在前往深圳住院前，提前了解东莞医保的异地就医政策并按规定办理相关手续，以便能够顺利享受医保报销待遇。