在福建莆田进行经肛门直肠肿瘤切除术是可以使用医保报销的。根据已有的信息，直肠肿瘤手术属于社会医疗保险报销的范畴，可以利用医保报销。具体到经肛门直肠肿瘤切除术，这是一种治疗直肠肿瘤的微创手术方法，适用于生长或转移播散至直肠部位的良性或恶性肿瘤的切除。
实际报销的比例和条件会受到多种因素的影响，包括但不限于：
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医保类型：不同类型的医保（如城镇职工基本医疗保险、城乡居民基本医疗保险）有不同的报销比例。例如，城镇居民或者是新农合的报销比例一般是在50%左右，而职工医保的报销比例可以达到70%左右。
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医院级别和地区差异：三甲医院设备先进、医疗技术水平高，手术费用相对较高；二级医院费用相对较低。一线城市由于医疗资源集中、经济发达，手术费用普遍较高。
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患者自身情况：包括病情的严重程度、是否出现并发症等也会影响最终的报销额度。对于较为严重的病例，可能需要更多的辅助治疗，这些额外的治疗成本可能不在基本医保的报销范围内。
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当地政策规定：每个地方的医保报销政策都有所不同，具体的报销比例也会有所差异。在莆田市，建议患者事先咨询当地的医疗机构或社保部门，了解最新的报销政策和流程。
为了确保能够顺利享受医保报销，患者应当准备好所有必要的材料，并按照当地的规定程序申请报销。通常情况下，这包括提供社会保障卡、填写《莆田市医疗保险门诊特殊病种和治疗项目申请表》等相关文件。需要注意的是，只有在选定的两家定点医疗机构就诊才能享受门诊特殊病种医保报销。
虽然经肛门直肠肿瘤切除术可以通过医保报销，但具体的报销金额和流程需要根据患者的实际情况以及当地的相关政策来确定。强烈建议患者提前与医院及社保机构沟通确认相关信息。