新型农村合作医疗（简称新农合）对慢性病患者的住院报销比例根据不同的因素有所不同，这些因素包括但不限于就诊的医疗机构级别、所在地区以及具体的政策规定。以下是关于新农合慢病证住院报销的一些详细信息：

对于持有慢病卡的患者，在相应病种年度报销限额内，按新规范围内费用的一定比例进行报销。例如，门诊慢特病报销时不设起付线，通常在70%左右。但是，这个比例主要针对的是门诊治疗，对于住院报销，情况会有所不同。

对于住院报销，报销比例依据医疗机构的等级而定。一般来说，镇卫生院的报销比例可以达到60%至90%，二级医院为40%，三级医院则为30%到50%不等。具体到慢病患者，如果他们需要住院治疗，那么其报销比例应当遵循上述标准，但需要注意的是，某些地方可能会有特别的规定或优惠政策，比如对特定慢性疾病给予更高的报销比例或者降低起付线。

对于特殊人群如65岁以上的老人，住院的新农合报销比例也有明确规定。例如，在镇卫生院、二级医院和三级医院的报销比例分别为60%、40%和30%。这一比例是否适用于所有持慢病证的老年患者，还需要查看当地的具体政策，因为各地可能有不同的调整。

值得注意的是，大病保险也会影响慢性病患者的报销比例。当患者的医疗费用超过一定的起付线后，超出部分可以按照较高的比例进行报销，最高限额可达25万元，并且对于一些重大疾病的补助病种定额的比例可能力争达到70%。这意味着，如果慢性病导致了高额的医疗费用，患者可以通过大病保险获得额外的帮助。

最后，由于各地的新农合政策存在差异，实际的报销比例和流程可能会有所变化。因此，为了获取最准确的信息，建议直接咨询当地的医保部门或相关机构，了解最新的报销政策和具体的实施细节。同时，考虑到政策可能随时调整，确保自己掌握最新的信息是非常重要的。

慢性病患者使用新农合慢病证住院时的报销比例受多种因素影响，具体情况需参照当地政策及医疗机构等级来确定。如果您需要进一步的帮助，可以提供更具体的背景信息，比如所在省份或城市，这样我可以为您提供更加精确的信息。