深圳医保余额为0的原因有很多，以下是其中的一些原因：
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缴纳的是城乡居民医保：目前我国有职工医保和城乡居民医保两种医疗保险，其中职工医保是设立有个人账户的，而城乡居民医保是没有个人账户的，没有个人账户的话，那么也就没有余额了。
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余额用完了：对于在职职工来说，医保个人缴费部分会全部进入到个人账户，而现在个人账户可以给子女、配偶和父母来使用了，扩大了使用范围。使用范围扩大了，余额用完的概率也就大了。所以如果你的医保个人账户的钱已经用完，那么医保就会显示余额为0。
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查询的是统筹账户：职工医保只有个人账户会显示余额，统筹账户是不显示余额的，如果参保人查询的是统筹账户，那么余额自然会显示为0。
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还没到返钱时间：对于退休人员来说，职工医保在缴纳最低缴费年限之后，退休之后就不用再继续缴费，然后就可以享受医保待遇，同时，个人账户也会有返钱。如果你个人账户的钱用完了，但个人账户还没有到返钱的时间，那么医保余额是为0的，等到了返钱的时间之后再查询就可以了。
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以灵活就业人员身份参保：灵活就业人员按照最低档缴费的不设立医保个人账户。每年缴费时社保部门会公布医保缴纳的标准，其中一档为低档，按照低档缴纳的，只有统筹基金，没有个人账户，所以不会返钱，但不影响生病住院时的报销比例。
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深圳医保的二三档：参加深圳基本医疗保险二档（原住院医疗）和基本医疗保险三档（原劳务工医疗），则没有医保个人账户，只能在绑定的医疗机构看门诊，费用由统筹基金按照医保办法相关规定支付。