南京大病二次报销流程可能因具体的医保类型（如职工医保、居民医保等）和病情的不同而有所差异。以下是根据搜索结果整理的一般流程：

1. 确认资格：

   • 确保患者已经参加了南京市的基本医疗保险（包括职工医保和居民医保）。
   • 确认患者的医疗费用已经超出了基本医疗保险的报销范围和最高支付限额。

2. 准备材料：

   • 患者或家属需要准备相关的申请材料，这些材料通常包括患者的身份证或户口簿原件、医保卡原件、新农合补偿结算单（如果适用）、费用清单、出院小结或加盖原件收取单位公章的复印件、医疗机构费用发票或加盖原件收存单位公章的复印件等。

3. 提交申请：

   • 将准备好的申请材料提交给所在单位或社区（村）委会进行初步审核。
   • 单位或社区（村）委会审核通过后，会盖章确认，并将申请材料报送至市医保中心或乡镇人民政府、街道办事处进行进一步审核。

4. 等待审核：

   • 医保部门会对提交的申请材料进行审核，确认申请人所提交的资料真实完整且所申请的病种病情符合要求。

5. 领取报销款项：

   • 审核通过后，保险资金将直接从城镇居民医保和新农合中划拨至申请人提供的银行账户，无需居民再额外支付。

总的来说，具体的流程和所需材料可能因地区和政策的不同而有所差异。建议在申请前咨询当地医保部门或相关机构以获取准确信息。